需要注意的是，具体办理流程可能会因地区和相关政策的不同而有所差异，建议在办理前提前咨询南通市住房公积金管理中心，了解具体要求和流程。
办理南通住房公积金贷款抵押权注销手续的具体步骤如下：
1. 准备材料：身份证原件及复印件、房产证原件及复印件、贷款合同原件及复印件、注销申请表。
2. 前往南通市住房公积金管理中心：携带以上材料前往南通市住房公积金管理中心的贷款部门。
3. 咨询窗口：在贷款部门咨询注销抵押权的办理流程，并填写注销申请表。
4. 递交申请材料：将填写完的注销申请表及相关材料递交给工作人员，等待审核。
5. 审核过程：工作人员会对申请材料进行审核，确认材料齐全并无误后，办理注销手续。
6. 缴纳相关费用：按照规定，办理注销抵押权需要缴纳一定的手续费，可根据工作人员要求进行缴纳。
7. 办理注销手续：经审核通过后，工作人员会办理注销手续，解除抵押权。
8. 办结：完成注销手续后，工作人员会将相关文件和注销证明交予申请人。
需要注意的是，具体办理流程可能会因地区和相关政策的不同而有所差异，建议在办理前提前咨询南通市住房公积金管理中心，了解具体要求和流程。